与传统堆肥发酵相比，利用有机肥发酵罐发酵畜禽粪污具有以下优势：占地面积小，自动化程度高，一人操控即可完成发酵处理全部过程；通过除臭系统实现气体达标排放，不产生二次污染；设备主体采用不锈钢特殊材质，减少腐蚀，使用寿命长；主体保温设计，辅助加热确保低温环境下设备正常运行。用时利用发酵罐发酵畜禽粪污具有以下缺点：有机肥设备投资较大,耗能高，运行成本高；由于传统堆肥受外界温度影响较大，有机肥发酵罐与传统堆肥相比，温暖季节生产效率较低，寒冷季节生产效率高。
槽式有机肥发酵设备。槽式发酵需要的设备是槽式发酵翻堆机，该翻堆机具有处理量大、占地小、操作简单、可实现无人驾驶等优点。但因为要建发酵槽，造成发酵场固定，有一定的局限性，透气性也没有条垛式好。目前，槽式发酵有机肥翻堆机在翻抛功能的基础上有些设计有加氧装置，可增加透气性；有些增加了打碎搅拌功能，适合于粪便型、糟渣类和纤维较多、黏性小的发酵物，这样可以省却原料搅拌打碎这些前处理工序，减少了生产环节。槽式有机肥翻堆机因其在固定轨道上行走，大多采用电机驱动，其价格主要与其电机功率有关。
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